Witam, chciałbym nauczyć się robić flagę, dlatego pytanie, trenowanie jakich mięśni powinno być moim priorytetem?

Wszystkich . Najważniejsze jednak są mięśnie korpusu, wszystkie mięśnie brzucha ( proste, skosy i poprzeczne) i pleców.

A jaki powinienem przyjąć typ treningu? Masa, siła, wytrzymałość?

Masa i siła to praktycznie jeden tryb treningu większą różnicę robi tu dieta niż trening. Istnieją owszem treningi mające na celu rozwój siły ale nie dla ludzi z twoim stażem.
Bardzo ważnym parametrem, który powinieneś rozwijać jest wytrzymałość siłowa i świadomość ciała. Spróbuj poszukać treningu pod gimnastykę. Ogólnie naucz się też jak wykonywać flagę, np. nie wiem czy wiesz ale tą ręką która jest u góry ciała podczas wykonywania tego triku przyciągasz się a tą która jest od dołu ciała odpychasz się od "słupka" na którym wykonujesz to ćwiczenie. Nie utrzymujesz obu rąk napięty w taki sam sposób trzymając ręce zaciśnięte z całej siły. Dużo daje sama świadomość jak wykonać ćwiczenie. Wykonuj dużo mostków na przedramionach i mostków bocznych bo to świetne ćwiczenia na mięśnie poprzeczne brzucha, te drugie aktywują też trochę skosy.